Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim45Q6PFY8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms