Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms