Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herc4Q6PAV2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms