Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2mQ6P6I6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms