Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms