Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms