Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six3Q62233 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Six3Q62233 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms