Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms