Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga6Q61739 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga6Q61739 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms