Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Trpc1Q61056 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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