Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ift20Q61025 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ift20Q61025 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms