Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JrkQ60976 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JrkQ60976 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms