Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Laptm4aQ60961 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms