Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms