Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2cQ60772 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms