Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsr1Q5SWD9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms