Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms