Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms