Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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