Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms