Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl5Q5DTT4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms