Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf608Q56A10 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf608Q56A10 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms