Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa20Q45VN2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms