Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn4Q3UWL8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pfdn4Q3UWL8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn4Q3UWL8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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