Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgef9Q3UTH8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms