Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf48Q3US17 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf48Q3US17 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Znf48Q3US17 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Znf48Q3US17 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Znf48Q3US17 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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