Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp560Q3URI6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms