Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Tmem253Q3UNB8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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