Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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