Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc136Q3TVA9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc136Q3TVA9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms