Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms