Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RogdiQ3TDK6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RogdiQ3TDK6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms