Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms