Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnn2Q08093 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms