Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms