Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms