Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VcpQ01853 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms