Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1cQ01815 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms