Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb4P99026 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms