Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SgcdP82347 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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