Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx3P81067 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx3P81067 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms