Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms