Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms