Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra8P70278 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra8P70278 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms