Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plxna3P70208 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plxna3P70208 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms