Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms