Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms