Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl5P47962 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms