Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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