Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prim2P33610 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms